在“艾利萨·彼得”号倾覆后，“柏林”号炮舰很快也遭到了厄运，法国巡洋舰“奥波尼阿特”号和“昂布斯卡德”号用大口径舰炮击沉了它，舰员大都阵亡，仅有少数人泅水上岸。
  水面上的主要战斗结束后，孤拔下令舰队扫荡江面，准备进攻港区。恶战结束，江面上到处是漂浮的尸体和待救的落水者，停在港内的中立**舰立刻放下舢板，救援落水者。但杀红了眼的法**舰，此时却没有如此绅士了，各舰不断传出步枪射击的声音，在残酷地屠杀落入水中的普鲁士官兵，一位法国舰长这样回忆道：“水面上满是木块、折断的桅和船体的碎片，攀援在这些漂流破物上的是那些想法活命的可怜的普鲁士士兵，他们的头部浮出水面，像些小黑点。我们的水兵，自开战即表现了令人羡慕的精神和纪律，现在因战斗过于兴奋，要阻止他们对这些在水上漂流的黑点用枪射击，是非常困难的事。”
  肃清水面后，法舰开始向岸上试探性射击，普军事前布署埋设在岸边的地雷，被法舰射击引爆，产生了剧烈爆炸。法**舰以为是普军炮兵在开火，因而开始集中炮击附近的普军炮台。
  炮战至10时45分，普军的一处弹药库被击中，岸上又一次发生剧烈爆炸。11时，孤拔下令停止炮击，预备结束战斗。当法**舰的炮火稍一停歇，一队普军炮兵使用隐蔽炮台的克虏伯大炮开始向“海洋”号铁甲舰发起猛烈炮击，“海洋”号被击中，包括孤拔的副官莱威尔少校在内的5名法军官兵被击伤。孤拔大怒，下令集中火力轰击，那座英勇的普鲁士炮台很快被法军炮火压制，火炮全被摧毁，11时55分，炮声平息了下来。
  在这场战斗中，普鲁士损失军舰7艘，1600余人阵亡，法舰无一损失，阵亡仅26人，受伤72人。
  基尔港的水面战斗结束时，两艘法国巡洋舰“阿罗于德”号和“恩伯拉卡波”号不约而同的出现在港外，此二舰是在完成了作战任务后前来向孤拔报告战果并支援战斗的。
  在孤拔率领快速支队主力进攻基尔港的同时，第一分队也赶到了亚德港展开了攻击，在亚德港驻守的是普鲁士海军“弗里德里希·卡尔”号铁甲舰，该舰排水量7043吨，拥有16门210毫米火炮，是普鲁士海军的主力舰之一，但它要面对的敌手是两艘强大的法国铁甲舰“赫罗英”号和“萨伏阿”号，“赫罗英”号和“萨伏阿”号是同级舰，排水量均为6070吨，拥有8门240毫米炮和3门190毫米炮；支援它们的“阿罗于德”号巡洋舰排水量1388吨，拥有9门150毫米炮，铁甲舰“阿米德”号排水量3569吨，拥有6门190毫米炮，无论是吨位和火力，法舰都占有绝对的优势。
  第一分队到达亚德港后，和孤拔在基尔港的做法如出一辙（都是一个师父教出来的），先以猛烈的炮火摧毁了港口处的普军岸防炮台，然后冲进港内，在得知法舰来袭后，“弗里德里希·卡尔”号铁甲舰及时起锚，并打算冲出港口，但却没能成功，第一分队指挥官为了预防普舰逃蹿，先行让铁甲舰“阿米德”号堵在了航道上，然后指挥官利士比海军中校率领两艘铁甲舰和一艘巡洋舰冲进港围攻“弗里德里希·卡尔”号，陷入围攻中的“弗里德里希·卡尔”号在舰长马克海军上校的带领下拼命抵抗，但无法抵挡法舰的优势炮火，在法国铁甲舰240毫米主炮的猛烈轰击下，“弗里德里希·卡尔”号很快化成了一堆燃烧的废铁。马克舰长在最后的关头开动战舰冲滩搁浅，在发现“弗里德里希·卡尔”号已经没有了抵抗力，舰上的官兵也逃散落了之后，为了节省炮弹，法国水兵乘坐小艇登上了“弗里德里希·卡尔”号，引爆了该舰的弹药库，将该舰彻底炸毁。
  在最后料理了“弗里德里希·卡尔”号的残骸之后，法舰驶近岸边的位置，意外的发现这里停泊着大批古老的木质风帆战船，由于风向不对，这些风帆时代的老爷船一直被株守在岸边无法动弹，在看到“弗里德里希·卡尔”号被摧毁后，上面的普鲁士水手们一跑而光。法国人对付这些看起来如同工艺品一样的木头船，连打靶的兴趣都没有了，不想浪费炮弹的利士比干脆派出水兵乘座蒸汽舢舨上前，一艘接一艘的纵火焚烧起来，上演了一幕西方版的“火烧赤壁”。
  “……普军各木帆船以风急不能行，坐以待毙，弁勇星散，法军水勇从容纵火燃之，烟焰冲天，延及岸上屋宇，大火三日不熄……”（《林义哲日记》）
  在第一分队攻击亚德港的同时，第二分队在波特尔中校的带领下，对停泊在易北河口的普鲁士铁甲舰“阿米纽斯”号展开了攻击。
  “阿米纽斯”号是一艘小型铁甲舰，排水量仅有1917吨，拥有两座双联装210毫米圆形主炮塔，以中线首尾布置，是普鲁士海军的第一艘铁甲舰。现被当成一艘岸防舰用于易北河口的防务。
  值得注意的是，“阿米纽斯”号铁甲舰是普鲁士为了应付同丹麦的战争需要而从英国订购的，普丹战争中普鲁士取得了胜利，令丹麦人恨之入骨。此次法国海军进攻基尔的行动，理所当然的得到了丹麦海军的暗中支援。
  当法国舰队到达易北河口时，“阿米纽斯”号铁甲舰正在巡逻，发现法舰之后，“阿米纽斯”号试图逃跑，但很快便被法舰追及，在面对排水量6420吨、拥有2门240毫米炮和10门190毫米炮的“科伦”号铁甲舰及排水量6220吨、拥有8门240毫米炮和4门190毫米炮的“复仇“号铁甲舰面前，“阿米纽斯”号没有丝毫取胜的希望，大约20分钟之后，“阿米纽斯”号便被打得从头到脚一片火海，不久便爆炸沉没了。在负责支援的老式铁甲舰“法兰德”号和巡洋舰“女妖”号赶到的时候，海面上仅剩下“阿米纽斯”号的桅杆。
  “海洋”号铁甲舰的甲板下住舱里，孤拔起草了给法国政府的报告，并准备了一份致参战各舰的褒奖令：
  “普鲁士的士兵们在法兰西国土上的暴行，已经由你们在基尔的同伴和你们的勇敢报了仇，但法国要求一种更光彩的补偿，有了像你们这样勇敢的水兵，她可以获得一切。——孤拔”
  摧毁了普鲁士海军的法**舰，艘艘都处在极度激昂的胜利者情绪中。只不过三色旗下，司令官孤拔望着眼前的景况，却在考虑另外的计划。
  根据法国政府的命令，孤拔此战的真正任务是占领基尔港，为法国陆军的登陆扫清障碍。而歼灭普鲁士海军是为了攻占基尔的预先准备活动。
  与那些突击冒进的法国陆军将领等人不同，孤拔在指挥作战方面始终表现着稳健的风格，没有完全的把握，绝不会做冒险一博。仔细思索后，孤拔决定各舰集中火力猛烈炮击附近的普军炮台，“各舰以榴弹对岸上可疑目标及周围射击”。下午2时，在军舰炮火的掩护下，“郭罗阿斯”号和“絮尔弗兰特”号搭载的几十名登陆队官兵乘坐舢板，强行登岸，发现普军炮兵都已不知去向，于是将一座临时炮台内的4门克虏伯大炮当作战利品，全部运回了军舰。
  看到附近的炮台已被清除，孤拔重新布署战斗行动。3时许，运输舰“阿尔通”号搭载的法国陆军，由皮埃尔少校率领最先离开，划着舢板向山脚下的海滩出发。3时30分，法军皮埃尔大队成功登上海滩，迅速向内陆挺进。让法军顿感意外的是，竟没有找到任何普鲁士军队的踪影，各个普军工事相继轻松地落入法军手中。“普鲁士军队莫名其妙的失踪了，剩下一些表面上看起来不会伤人的平民。”5时许，迎着四下招展的红白蓝三色旗，孤拔踏上了基尔的土地。不久，法军进入基尔城中，仍然没有找到任何普鲁士军队的踪迹，基尔就这样落入法军手中。
  对于这戏剧性的一幕，法国陆军将领们都很奇怪，以至于他们没有下令部队继续前进，而是先行固守基尔。根据孤拔的要求，法国陆军派出了侦察部队，向内陆搜索，依然没有发现普鲁士军队的踪影。
  孤拔和法国陆军将领们并不知道，事实上，在他们进攻基尔之前，基尔的守军就已经没有多少人了。由于法普前线战事惨烈，普军伤亡过大，兵力严重不足，普鲁士政府迫不得已，从各地抽调部队补充前线，基尔港守军自然也不能幸免。
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